Не вижу в журналах сервера каких-либо выброшенных исключений, связанных с пасеками из Gendustry.
Это может о многом говорить, но для начала надо исключить возможность кражи содержимого игроками и некорректной работой рядом расположенных механизмов.
Если проблема вновь повторится, сообщите координаты блока и предположительное время.